9个国家一级重点学科，11个国家二级重点学科，7个国家重点（培育）学科、27个上海市重点学科。

一级学科国家重点学科
# 力学
# 机械工程
# 材料科学与工程
# 动力工程及工程热物理
# 控制科学与工程
# 计算机科学与技术
# 船舶与海洋工程
# 生物医学工程
# 管理科学与工程

二级学科国家重点学科
# 凝聚态物理
# 光学
# 遗传学
# 生物化学与分子生物学
# 电磁场与微波技术
# 通信与信息系统
# 病理学与病理生理学
# 内科学
# 儿科学
# 外科学
# 口腔临床医学